НКЦ 1
- Отделение реконструктивно-восстановительной сердечно-сосудистой хирургии (I КХ)
- Отделение хирургического лечения дисфункций миокарда и сердечной недостаточности (II КХ)
- Отделение хирургии пороков сердца (III КХ)
- Отделение хирургии ишемической болезни сердца (IV КХ)
- Отделение рентгенохирургических (рентгенэндоваскулярных) методов диагностики и лечения
- Отделение хирургического лечения сложных нарушений ритма сердца и электростимуляции
- Отделение сосудистой хирургии
- Отделение торакальной хирургии и онкологии
- Отделение пересадки печени
- Отделение пересадки почки
- Нейрохирургическое отделение
- Отделение общей онкологии и реконструктивно-пластической хирургии
- Отделение противоопухолевой лекарственной терапии с дневным стационаром
- Отделение торако-абдоминальной хирургии и онкологии
- Эндоскопическое отделение
- Отделение рентгенодиагностики и компьютерной томографии
- Лаборатория ультразвуковой диагностики
- Лаборатория интраоперационной диагностики
- Лаборатория электрофизиологии и нагрузочных тестов
- Консультативно-диагностическое отделение
- Отделение терапии болевых синдромов (Клиника изучения и лечения боли)
- Отделение патологоанатомическое I (патоморфологическое)
- Лаборатория медицинской генетики
- Клинико-диагностическая лаборатория
- Кабинет гипербарической оксигинации (ГБО)
- Отделение трансфузиологии
- Централизованное отделение клинической фармакологии
- Приемное отделение
- Отделение анестезиологии-реанимации I
- Отделение анестезиологии-реанимации II
- Отделение реанимации и интенсивной терапии I
- Отделение реанимации и интенсивной терапии II
НКЦ 2
- Отделение челюстно-лицевой и реконструктивно-пластической хирургии
- Отделение абдоминальной хирургии и онкологии III
- Гинекологическое отделение
- Отделение медицинской реабилитации стационара и лечебно-диагностического центра
- Нейрохирургическое отделение
- Отделение неотложной медицинской помощи
- Отделение трансфузиологии
- Отделение реанимации и интенсивной терапии II
- Отделение анестезиологии-реанимации
- Отделение оперативной и клинической офтальмологии
- Отделение аллергологии и иммунологии стационара
- Патологоанатомическое отделение стационара
- Отделение функциональной диагностики стационара
- Приемное отделение стационара
- Кабинет аллергологии и иммунологии стационара
- Отделение реанимации и интенсивной терапии
- 2-е терапевтическое отделение
- Урологическое отделение с кабинетом литотрипсии
- Отделение ультразвуковой диагностики стационара НКЦ №2
- Стоматологическое отделение
- Хирургическое отделение
- Центр неврологии, эпилептологии и пароксизмальных состояний
- Кардиологическое отделение
- Дневной стационар хирургического профиля
- Отделение абдоминальной хирургии и онкологии I
- Клинико-диагностическая лаборатория НКЦ №2
- Отделение радионуклидных методов диагностики