Начало Научному музею хирургии РНЦХ им. акад. Б.В. Петровского было положено в 1981 г. Инициаторами создания музея были академик Б.В. Петровский, член-корр. РАМН Э.Н. Ванцян и проф. Г.Д. Чеснокова, которая и стала первым директором музея, прияв самое активное участие в его формировании. С 1995 по 2008 гг. директором музея был проф. В.И. Соколов.

Основой для создания музея послужили многочисленные исторические материалы и документы, накопленные и бережно сохраненные за более, чем полуторавековую историю кафедры госпитальной хирургии Императорского Московского университета, представленные для обозрения на 4-ом этаже главного здания РНЦХ им. акад. Б.В. Петровского, где расположилась основная экспозиция музея.

Тематические стенды и витрины отражают историю создания, становления и развития различных клинических и вспомогательных подразделений РНЦХ.

В 3 небольших комнатах музея созданы экспозиции, посвященные отцу русской хирургии Н.И. Пирогову, учителю Б.В. Петровского проф. П.А. Герцену и самому основателю нашего Центра академику Б.В. Петровскому, мемориальный кабинет-музей которого расположен на 7 этаже кардиокорпуса РНЦХ и является частью научного музея Центра.

Мемориальный кабинет-музей Б.В. Петровского постоянно пополняется новыми экспонатами, которые дарят его коллеги, ученики, ученики его учеников и многочисленные почитатели. Кабинет-музей академика Б.В. Петровского – действующий: кроме экспозиционной и просветительской деятельности он предназначен и для повседневной научной работы, которую осуществляет Центр хирургии. Здесь проводятся не только экскурсии для студентов, аспирантов, ординаторов, врачей-курсантов, но также различные заседания и совещания руководства и сотрудников подразделений РНЦХ, встречи с гостями.